Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms