Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TRAF3Q13114 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TRAF3Q13114 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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