Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1BQ13112 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms