Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC16Q13042 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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