Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXD4Q12950 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXD4Q12950 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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