Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXF2Q12947 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXF2Q12947 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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