Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFRD2Q12894 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFRD2Q12894 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms