Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms