Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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