Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FOXO1Q12778 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXO1Q12778 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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