Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YDR193WYDR193W 399 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 SPT16YGL207W 3108 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 COS111YBR203W 2775 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 CHS3YBR023C 3498 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 TIM12YBR091C 330 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 APL4YPR029C 2499 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 TOP1YOL006C 2310 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 USA1YML029W 2517 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 PRE4YFR050C 801 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 RAM2YKL019W 951 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 TOM5YPR133W-A 153 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 PSK2YOL045W 3306 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 FLO10YKR102W 3510 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 GUP1YGL084C 1683 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 COX14YML129C 213 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 REG1YDR028C 3045 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 USE1YGL098W 738 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 ECM12YHR021W-A 456 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 GIS2YNL255C 462 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 EMC1YCL045C 2283 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 APC1YNL172W 5247 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 RSC30YHR056C 2652 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 NTO1YPR031W 2247 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 NOP53YPL146C 1368 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 GIS4YML006C 2325 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 HSC82YMR186W 2118 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 FAR1YJL157C 2493 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 PAN3YKL025C 2040 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 XRS2YDR369C 2565 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 PMP1YCR024C-A 123 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YMR31YFR049W 372 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 EFR3YMR212C 2349 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 KEL2YGR238C 2649 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 PLC1YPL268W 2610 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 MET10YFR030W 3108 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 RIX1YHR197W 2292 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 PIG1YLR273C 1947 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 PMP2YEL017C-A 132 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 CHD1YER164W 4407 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 SPB1YCL054W 2526 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 KRE5YOR336W 4098 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 RPS17AYML024W 411 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YOR333CYOR333C 417 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 VMA9YCL005W-A 222 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 FLO8YER109C 2400 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 VPH1YOR270C 2523 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 XRN1YGL173C 4587 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 SEG1YMR086W 2883 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YBL065WYBL065W 345 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YOR218CYOR218C 420 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 RPL33BYOR234C 324 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 SGD1YLR336C 2700 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 SWI3YJL176C 2478 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 VBA4YDR119W 2307 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 YCL019WYCL019W 5313 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-DR3Q12441 HEH2YDR458C 1992 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YGR051CYGR051C 324 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YIL165CYIL165C 360 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 BCH1YMR237W 2175 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 SIZ1YDR409W 2715 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 MCM10YIL150C 1716 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 PHO81YGR233C 3537 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 MCD4YKL165C 2760 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 NUP159YIL115C 4383 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 SBH1YER087C-B 249 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YIR044CYIR044C 186 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YJL022WYJL022W 309 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 POM152YMR129W 4014 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 BAS1YKR099W 2436 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 IPT1YDR072C 1584 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 PSO2YMR137C 1986 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YEL043WYEL043W 2871 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 SPT6YGR116W 4356 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 NOP4YPL043W 2058 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 SSQ1YLR369W 1974 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YAK1YJL141C 2424 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 MYO5YMR109W 3660 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 RPL25YOL127W 429 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 OSH3YHR073W 2991 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 APE2YKL157W 2859 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 RLI1YDR091C 1827 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 BRP1YGL007W 378 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 ELG1YOR144C 2376 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 INP2YMR163C 2118 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms