Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 MUK1YPL070W 1839 nt4.67□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 VID27YNL212W 2349 nt4.67□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 RAD4YER162C 2265 nt4.66□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 SIP3YNL257C 3690 nt4.66□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 YDR286CYDR286C 345 nt4.66□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 SNU114YKL173W 3027 nt4.66□□□□□ -1.66
NOP53Q12080 PMP1YCR024C-A 123 nt4.65□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 LSO2YGR169C-A 279 nt4.65□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 TRX1YLR043C 312 nt4.65□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 snR191snR191 274 nt4.65□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 IPT1YDR072C 1584 nt4.65□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YEL073CYEL073C 324 nt4.64□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt4.64□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 FAS2YPL231W 5664 nt4.64□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 JEN1YKL217W 1851 nt4.64□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 VTC4YJL012C 2166 nt4.64□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YOL057WYOL057W 2136 nt4.63□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 FPR1YNL135C 345 nt4.63□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 RPL20BYOR312C 519 nt4.63□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 SLM2YNL047C 1971 nt4.63□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 APL4YPR029C 2499 nt4.63□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt4.62□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 PMP2YEL017C-A 132 nt4.62□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt4.62□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 MSR1YHR091C 1932 nt4.62□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 NOG1YPL093W 1944 nt4.62□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 SPB1YCL054W 2526 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 RPS17BYDR447C 411 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 POG1YIL122W 1056 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YLR416CYLR416C 399 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 RPO21YDL140C 5202 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 CIN1YOR349W 3045 nt4.61□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 SPT21YMR179W 2277 nt4.6□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 YGL069CYGL069C 465 nt4.6□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 RSM19YNR037C 276 nt4.6□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 HSC82YMR186W 2118 nt4.6□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 VPS53YJL029C 2469 nt4.6□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.59□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 GIS2YNL255C 462 nt4.59□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 DFG16YOR030W 1860 nt4.59□□□□□ -1.67
NOP53Q12080 SPO21YOL091W 1830 nt4.58□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 RPS17AYML024W 411 nt4.58□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 EMC1YCL045C 2283 nt4.58□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 HEF3YNL014W 3135 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 PWP2YCR057C 2772 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YDR193WYDR193W 399 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YGL024WYGL024W 336 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 CDC20YGL116W 1833 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 RAD26YJR035W 3258 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 KAR3YPR141C 2190 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 SPT16YGL207W 3108 nt4.57□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 MCD4YKL165C 2760 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 NCR1YPL006W 3513 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 TMN3YER113C 2121 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 COX23YHR116W 456 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 RPS23BYPR132W 438 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 ASG1YIL130W 2895 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 TAF6YGL112C 1551 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YCG1YDR325W 3108 nt4.56□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YGL140CYGL140C 3660 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 MYO3YKL129C 3819 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 SEG1YMR086W 2883 nt4.55□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 NOP53YPL146C 1368 nt4.54□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 LSM7YNL147W 348 nt4.54□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 ZDS1YMR273C 2748 nt4.54□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 FAS1YKL182W 6156 nt4.54□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 DOT6YER088C 2013 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 RSC1YGR056W 2787 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 RPL22AYLR061W 366 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 GUP1YGL084C 1683 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 MLH2YLR035C 2088 nt4.53□□□□□ -1.68
NOP53Q12080 PRE4YFR050C 801 nt4.52□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 COG3YER157W 2406 nt4.52□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 CFT2YLR115W 2580 nt4.52□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 SLA1YBL007C 3735 nt4.51□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 BNI4YNL233W 2679 nt4.51□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 RDS1YCR106W 2499 nt4.51□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 ECM12YHR021W-A 456 nt4.51□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 RPL33BYOR234C 324 nt4.51□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 PIG1YLR273C 1947 nt4.5□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 TFC8YPL007C 1767 nt4.5□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 ALK2YBL009W 2031 nt4.5□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 SPT4YGR063C 309 nt4.49□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 PLC1YPL268W 2610 nt4.49□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 FAT1YBR041W 2010 nt4.48□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt4.48□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 YOR345CYOR345C 351 nt4.48□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 PRP22YER013W 3438 nt4.48□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 RSF2YJR127C 4143 nt4.48□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 BAS1YKR099W 2436 nt4.47□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 GIN4YDR507C 3429 nt4.47□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 COX14YML129C 213 nt4.47□□□□□ -1.69
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