Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 BRP1YGL007W 378 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YJL022WYJL022W 309 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 FMP46YKR049C 402 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 GCR1YPL075W 2358 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YOL075CYOL075C 3885 nt4.18□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 BAS1YKR099W 2436 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 CPA2YJR109C 3357 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 GSC2YGR032W 5688 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 SRO7YPR032W 3102 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YEL043WYEL043W 2871 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 GUP1YGL084C 1683 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 SSQ1YLR369W 1974 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 POG1YIL122W 1056 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 ULS1YOR191W 4860 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 PLC1YPL268W 2610 nt4.17□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 NOP53YPL146C 1368 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 RSC1YGR056W 2787 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 RPL6AYML073C 531 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 BRE4YDL231C 3378 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 CFT2YLR115W 2580 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YCF1YDR135C 4548 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 DOT6YER088C 2013 nt4.16□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 HFM1YGL251C 3564 nt4.15□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 TFC8YPL007C 1767 nt4.15□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt4.15□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 COX14YML129C 213 nt4.15□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 ALK2YBL009W 2031 nt4.15□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 GIN4YDR507C 3429 nt4.15□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YCG1YDR325W 3108 nt4.15□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 RIA1YNL163C 3333 nt4.14□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 ZDS1YMR273C 2748 nt4.14□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 TMA17YDL110C 453 nt4.14□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YIR044CYIR044C 186 nt4.14□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YOR333CYOR333C 417 nt4.14□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 HEH2YDR458C 1992 nt4.13□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 BNI4YNL233W 2679 nt4.13□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 VMA1YDL185W 3216 nt4.13□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 COG3YER157W 2406 nt4.13□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YOR345CYOR345C 351 nt4.12□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 ACM1YPL267W 630 nt4.12□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YDR341CYDR341C 1824 nt4.11□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 APC11YDL008W 498 nt4.11□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 RAM2YKL019W 951 nt4.11□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 YBR099CYBR099C 384 nt4.11□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 NUP120YKL057C 3114 nt4.11□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 TIM12YBR091C 330 nt4.1□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 RNR1YER070W 2667 nt4.1□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 FAS2YPL231W 5664 nt4.09□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 PAN3YKL025C 2040 nt4.09□□□□□ -1.75
TFB4Q12004 REG1YDR028C 3045 nt4.08□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YER053C-AYER053C-A 114 nt4.08□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 COY1YKL179C 2040 nt4.08□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YOR102WYOR102W 351 nt4.08□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 ABP140YOR239W 1887 nt4.08□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 DBP7YKR024C 2229 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 CLN3YAL040C 1743 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 MSH2YOL090W 2895 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YOR218CYOR218C 420 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 DUF1YOL087C 3351 nt4.07□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.06□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.06□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.06□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YMR31YFR049W 372 nt4.06□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YLR352WYLR352W 2424 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 SPT16YGL207W 3108 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YJL070CYJL070C 2667 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 MPT5YGL178W 2580 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YBL065WYBL065W 345 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 XRN1YGL173C 4587 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 APL4YPR029C 2499 nt4.05□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 MSK1YNL073W 1731 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 RIX1YHR197W 2292 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 RTC6YPL183W-A 282 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 SIR3YLR442C 2937 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 EFR3YMR212C 2349 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 MCM10YIL150C 1716 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 CCM1YGR150C 2595 nt4.04□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YAK1YJL141C 2424 nt4.03□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt4.03□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 SPC105YGL093W 2754 nt4.03□□□□□ -1.76
TFB4Q12004 EMC1YCL045C 2283 nt4.02□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.02□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 CHS3YBR023C 3498 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 PTC5YOR090C 1719 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 PUF4YGL014W 2667 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 RLI1YDR091C 1827 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 RPL25YOL127W 429 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 BCH1YMR237W 2175 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 TAF6YGL112C 1551 nt4.01□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 PSO2YMR137C 1986 nt4□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 INP2YMR163C 2118 nt4□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 TOP1YOL006C 2310 nt4□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YGL140CYGL140C 3660 nt4□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 PHO81YGR233C 3537 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.99□□□□□ -1.77
TFB4Q12004 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms