Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASGEF1BQ0VAM2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms