Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms