Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms