Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms