Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABPB1Q06547 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms