Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms