Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 ASG1YIL130W 2895 nt2.51□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RLI1YDR091C 1827 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YDL041WYDL041W 354 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 CAJ1YER048C 1176 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YER189WYER189W 369 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 AAD16YFL057C 459 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RPL25YOL127W 429 nt2.5□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 FAR11YNL127W 2862 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YIL080WYIL080W 4722 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YDR008CYDR008C 351 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RPL40AYIL148W 387 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 PAU14YIL176C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 PAU1YJL223C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 TMA22YJR014W 597 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 LCL2YLR104W 396 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 CCW14YLR390W-A 717 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 KTI11YBL071W-A 249 nt2.49□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 TCB2YNL087W 3537 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 MAM33YIL070C 801 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RAM2YKL019W 951 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YLR031WYLR031W 561 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 FMP23YBR047W 528 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 SRO77YBL106C 3033 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 BCK1YJL095W 4437 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 NAB3YPL190C 2409 nt2.48□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 CDC24YAL041W 2565 nt2.47□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 NHP2YDL208W 471 nt2.47□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 RPL14BYHL001W 417 nt2.47□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 YHL037CYHL037C 402 nt2.47□□□□□ -2.01
PDR8Q06149 IRC10YOL015W 1761 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 snR79snR79 84 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDL152WYDL152W 366 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YAR053WYAR053W 297 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RGM1YMR182C 636 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 ATP3YBR039W 936 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RSE1YML049C 4086 nt2.46□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 snR76snR76 109 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR413CYDR413C 576 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 MSL1YIR009W 336 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RPS18BYML026C 441 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RPL9BYNL067W 576 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 BIL1YOR304C-A 231 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 GCV2YMR189W 3105 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 PSK2YOL045W 3306 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YER138CYER138C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YER160CYER160C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YJR027WYJR027W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YML039WYML039W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YML045WYML045W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YMR050CYMR050C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.45□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 DNL4YOR005C 2835 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YER097WYER097W 330 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YFR056CYFR056C 369 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YJL202CYJL202C 348 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YMR324CYMR324C 243 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 FPR1YNL135C 345 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 TIM18YOR297C 579 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 ROX1YPR065W 1107 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YBR197CYBR197C 654 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RPO41YFL036W 4056 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 FKS3YMR306W 5358 nt2.44□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YBT1YLL048C 4986 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 SEC26YDR238C 2922 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 NUM1YDR150W 8247 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 snR70snR70 164 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YDR102CYDR102C 333 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 TWF1YGR080W 999 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 SWT1YOR166C 1377 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 MSS11YMR164C 2277 nt2.43□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 AYR1YIL124W 894 nt2.42□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.42□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 UTP30YKR060W 825 nt2.42□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 RTT10YPL183C 3042 nt2.42□□□□□ -2.02
PDR8Q06149 MLH1YMR167W 2310 nt2.42□□□□□ -2.02
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