Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 ASM4YDL088C 1587 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 MZM1YDR493W 372 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 BI2Q0110 1272 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 RPL40AYIL148W 387 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YJR079WYJR079W 330 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 SHE2YKL130C 741 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YLR031WYLR031W 561 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 SYM1YLR251W 594 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YML108WYML108W 318 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 SLM6YBR266C 453 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.91□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YJL016WYJL016W 1686 nt1.9□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 NUP100YKL068W 2880 nt1.9□□□□□ -2.1
YHC1Q05900 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 RRF1YHR038W 693 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 RPC10YHR143W-A 213 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YJL007CYJL007C 315 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 SEN15YMR059W 387 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 INO80YGL150C 4470 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 SPE1YKL184W 1401 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 RGA1YOR127W 3024 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 NUP82YJL061W 2142 nt1.9□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YDL118WYDL118W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 ECL1YGR146C 636 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YPL205CYPL205C 345 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 PRK1YIL095W 2433 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 NAB6YML117W 3405 nt1.89□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 RNH70YGR276C 1662 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YFH1YDL120W 525 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YRB1YDR002W 606 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 EMP24YGL200C 612 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 PET191YJR034W 327 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 IRC19YLL033W 693 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YLR379WYLR379W 375 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 TOM22YNL131W 459 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 LSM7YNL147W 348 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 snR54snR54 86 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 SOK2YMR016C 2358 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 MUD2YKL074C 1584 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 SEC31YDL195W 3822 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 PPN1YDR452W 2025 nt1.88□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 CDC50YCR094W 1176 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 TIM9YEL020W-A 264 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 AIM29YKR074W 468 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 TSC3YBR058C-A 243 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 snR41snR41 95 nt1.87□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 MPH1YIR002C 2982 nt1.86□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.86□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 NCE101YJL205C 162 nt1.86□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 KAP123YER110C 3342 nt1.86□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YHR125WYHR125W 306 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 PAU8YAL068C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YAR068WYAR068W 486 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 TMA10YLR327C 261 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 PAU20YOL161C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YOR248WYOR248W 303 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 ROX1YPR065W 1107 nt1.85□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 MSS11YMR164C 2277 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 RAV1YJR033C 4074 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 FKS1YLR342W 5631 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 NEO1YIL048W 3456 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 BFA1YJR053W 1725 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 VAR1Q0140 1197 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 VOA1YGR106C 798 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 YLR269CYLR269C 351 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 GRX8YLR364W 330 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 GYP5YPL249C 2685 nt1.84□□□□□ -2.11
YHC1Q05900 AFI1YOR129C 2682 nt1.84□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 NAN1YPL126W 2691 nt1.84□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 VPS52YDR484W 1926 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 GIP3YPL137C 3831 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 IRC10YOL015W 1761 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 UBR1YGR184C 5853 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 NBL1YHR199C-A 222 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 SNC1YAL030W 354 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RPS17AYML024W 411 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 VTI1YMR197C 654 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 COX7YMR256C 183 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YPR039WYPR039W 336 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 IPT1YDR072C 1584 nt1.83□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 DAD4YDR320C-A 219 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 ATP17YDR377W 306 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 NOP10YHR072W-A 177 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YJR157WYJR157W 363 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YKL063CYKL063C 504 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YNL324WYNL324W 396 nt1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.5 ms