Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMX2Q04743 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMX2Q04743 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMX2Q04743 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms