Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms