Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ID3Q02535 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ID3Q02535 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ID3Q02535 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms