Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms