Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms