Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms