Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms