Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNB1P98172 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms