Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRB1P82279 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms