Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP3K9P80192 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K9P80192 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms