Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms