Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms