Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms