Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms