Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms