Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms