Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX10P56693 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX10P56693 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX10P56693 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX10P56693 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms