Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLURP1P55000 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLURP1P55000 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms