Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms