Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms