Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACLYP53396 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms