Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms