Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK4P51957 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms