Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms