Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCR4P51679 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCR4P51679 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCR4P51679 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCR4P51679 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCR4P51679 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCR4P51679 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCR4P51679 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCR4P51679 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCR4P51679 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCR4P51679 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms