Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFBP49765 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms