Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP4P49662 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP4P49662 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP4P49662 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms