Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms