Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMTP48728 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMTP48728 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMTP48728 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMTP48728 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms